قدمت خديجة بن قنة العديد من البرامج السياسية والدينية والاجتماعية في قناة الجزيرة منها :
برنامج " ما وراء الخبر" وهو برنامج سياسي يومي ما زالت تقدمه حتى اليوم.
برنامج "الشريعة والحياة" وهو برنامج حواري ديني أسبوعي قدّمته لمدة سنة كاملة.
برنامج" للنساء فقط" وهو برنامج حواري اجتماعي أسبوعي كانت تقوم بإعداده وتقديمه لمدة سنة كاملة.
كما قامت خديجة بن قنة بإنجاز العديد من المقابلات مع شخصيات سياسية وعلمية وصناع القرار، مثل :
مقابلة مع موزة بنت ناصر المسند زوجة حاكم قطر.
مقابلة مع رئيس وزراء فرنسا السابق دومينيك دو فيلبان.
مقابلة مع العقيد معمر القذافي.
مقابلة مع الدكتور أحمد زويل الحائز على جائزة نوبل في الكيمياء.
مقابلة مع وزير الدفاع الفرنسي الأسبق آلان ريشارد.
مقابلة مع كارلا ساركوزي.
مقابلة مع الرئيس الإيراني محمود أحمدي نجاد.
مقابلة مع الرئيس المصري محمد مرسي .
شاركت خديجة بن قنة في العديد من المؤتمرات عن الحوار بين الإسلام والغرب منها مؤتمر برلين للحوار بين الأديان من تنظيم وزارة الخارجية الألمانية عام 2005